Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUSP28Q4G0W2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms