Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTLL9Q3SXZ7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTLL9Q3SXZ7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms