Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTU2Q2VPK5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.74
CTU2Q2VPK5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTU2Q2VPK5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTU2Q2VPK5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTU2Q2VPK5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms