Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms