Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SKIDA1Q1XH10 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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