Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC142Q17RM4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC142Q17RM4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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