Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN1Q16799 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN1Q16799 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
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