Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA9Q16795 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA9Q16795 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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