Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCSK7Q16549 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCSK7Q16549 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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