Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
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DDB1Q16531 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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DDB1Q16531 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
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DDB1Q16531 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
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DDB1Q16531 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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DDB1Q16531 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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DDB1Q16531 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
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DDB1Q16531 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DDB1Q16531 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
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