Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKN1Q16512 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
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