Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CST6Q15828 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CST6Q15828 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CST6Q15828 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CST6Q15828 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CST6Q15828 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CST6Q15828 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CST6Q15828 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CST6Q15828 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CST6Q15828 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CST6Q15828 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CST6Q15828 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CST6Q15828 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CST6Q15828 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CST6Q15828 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CST6Q15828 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CST6Q15828 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CST6Q15828 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CST6Q15828 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CST6Q15828 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CST6Q15828 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CST6Q15828 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CST6Q15828 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CST6Q15828 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CST6Q15828 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CST6Q15828 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CST6Q15828 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CST6Q15828 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CST6Q15828 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CST6Q15828 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CST6Q15828 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CST6Q15828 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CST6Q15828 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CST6Q15828 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CST6Q15828 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CST6Q15828 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CST6Q15828 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CST6Q15828 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CST6Q15828 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CST6Q15828 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CST6Q15828 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CST6Q15828 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CST6Q15828 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CST6Q15828 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CST6Q15828 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CST6Q15828 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CST6Q15828 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CST6Q15828 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CST6Q15828 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CST6Q15828 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CST6Q15828 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms