Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HERC1Q15751 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
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