Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRADDQ15628 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRADDQ15628 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms