Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKIV2LQ15477 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms