Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TLR1Q15399 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TLR1Q15399 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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