Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PCM1Q15154 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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PCM1Q15154 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCM1Q15154 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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PCM1Q15154 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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PCM1Q15154 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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PCM1Q15154 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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PCM1Q15154 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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PCM1Q15154 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCM1Q15154 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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