Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD1Q15011 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms