Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFIXQ14938 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
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