Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFTN1Q14699 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFTN1Q14699 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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