Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM53BQ14153 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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FAM53BQ14153 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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FAM53BQ14153 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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FAM53BQ14153 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53BQ14153 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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