Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE4AQ14139 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE4AQ14139 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
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