Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
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