Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX2Q13950 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms