Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXOSC2Q13868 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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