Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
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