Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PEX6Q13608 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PEX6Q13608 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PEX6Q13608 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX6Q13608 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX6Q13608 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX6Q13608 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX6Q13608 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX6Q13608 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX6Q13608 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX6Q13608 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX6Q13608 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PEX6Q13608 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PEX6Q13608 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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