Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA5AQ13591 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA5AQ13591 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms