Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PICALMQ13492 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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