Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SP140Q13342 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SP140Q13342 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SP140Q13342 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SP140Q13342 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SP140Q13342 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SP140Q13342 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SP140Q13342 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SP140Q13342 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SP140Q13342 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SP140Q13342 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SP140Q13342 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SP140Q13342 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SP140Q13342 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SP140Q13342 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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SP140Q13342 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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SP140Q13342 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP140Q13342 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP140Q13342 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP140Q13342 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP140Q13342 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP140Q13342 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP140Q13342 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP140Q13342 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SP140Q13342 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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SP140Q13342 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP140Q13342 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP140Q13342 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP140Q13342 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP140Q13342 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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SP140Q13342 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP140Q13342 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP140Q13342 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SP140Q13342 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SP140Q13342 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SP140Q13342 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SP140Q13342 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SP140Q13342 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SP140Q13342 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SP140Q13342 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SP140Q13342 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SP140Q13342 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SP140Q13342 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SP140Q13342 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SP140Q13342 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SP140Q13342 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SP140Q13342 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SP140Q13342 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SP140Q13342 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP140Q13342 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP140Q13342 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP140Q13342 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP140Q13342 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP140Q13342 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP140Q13342 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP140Q13342 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP140Q13342 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP140Q13342 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP140Q13342 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP140Q13342 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP140Q13342 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SP140Q13342 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP140Q13342 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SP140Q13342 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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