Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA3BQ13214 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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SEMA3BQ13214 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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