Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LCP2Q13094 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCP2Q13094 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms