Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKRN3Q13064 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKRN3Q13064 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
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