Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECH1Q13011 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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