Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYO1EQ12965 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYO1EQ12965 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms