Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFSWAPQ12872 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFSWAPQ12872 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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