Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFCP2Q12800 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TFCP2Q12800 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
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