Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
IFFO1Q0D2I5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFFO1Q0D2I5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms