Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms