Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL18Q07020 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL18Q07020 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL18Q07020 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL18Q07020 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL18Q07020 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL18Q07020 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL18Q07020 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL18Q07020 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL18Q07020 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL18Q07020 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms