Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDK18Q07002 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK18Q07002 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms