Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PSME1Q06323 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME1Q06323 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms