Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms