Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CENPEQ02224 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CENPEQ02224 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms