Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC10Q01780 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC10Q01780 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC10Q01780 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms