Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1BQ00975 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms