Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MYBPC1Q00872 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms