Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3AP98173 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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