Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED6P86452 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED6P86452 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED6P86452 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED6P86452 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms