Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKOR1P84550 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms